| 序号 | 项目名称 | 项目类别 | 经费来源 | 主持人 | 到位经费 |
| 1 | 秦川肉牛新品种选育及标准化生产技术集成与产业化示范 | 13115重大产业化项目 | 省科技厅（省财政厅）（50万） | 昝林森 | 500000 |
| 2 | 重大动物疫病综合防控技术研究 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 高玉鹏 | 90000 |
| 3 | 高效绿色饲料生产关键技术研究 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 姚军虎 | 270000 |
| 4 | 高效绿色饲料生产关键技术研究 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 龚月生 | 50000 |
| 5 | 高效绿色饲料生产关键技术研究 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 呼天明 | 150000 |
| 6 | 奶羊、肉羊高效生态养殖技术研究与示范 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 罗军 | 150000 |
| 7 | 奶羊、肉羊高效生态养殖技术研究与示范 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 周占琴 | 70000 |
| 8 | 奶羊、肉羊高效生态养殖技术研究与示范 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 曹斌云 | 30000 |
| 9 | 奶羊、肉羊高效生态养殖技术研究与示范 | 13115重大科技专项项目 | 省科技厅（省财政厅700万） | 校外 铜川 | 50000 |
| 10 | 宁南山区黄牛肉用性能测定与候选基因标记研究 | 宁夏自治区科技攻关项目 | 宁夏自治区畜牧工作站 | 陈宏 | 80000 |
| 11 | 生猪养殖业源产排污系数测算 | 农业部项目 | 中国农科院环发所 | 孙世铎 | 570000 |
| 12 | 良种奶山羊多羔性状分子标记辅助多基因聚合育种技术研究 | 863专题 | 科技部（财政部35万） | 曹斌云 | 350000 |
| 13 | 新型饲料添加剂—JYY80生物活性成分分离鉴定与发酵工艺 | 协作合作 | 江门市金远洋生物科技有限司 | 王高学 | 50000 |
| 14 | 西部高档肉牛产业化配套技术及产业化机制研究 | 公益性行业（农业）专项 | 中国农业大学 | 昝林森 | 1830000 |
| 15 | Sirt1通过Caspase-3调控猪前体脂肪细胞凋亡的分子机理 | 国家自然科学基金项目 | 财政部248.8万元 | 庞卫军 | 84000 |
| 16 | 畜禽种质资源标准化整理、整合及共享科技基础条件平台建设 | 教育部基础条件平台建设项目 | 中国农大 | 陈玉林 | 67500 |
| 17 | 牧草种质资源标准化整理、整合及共享 | 国家科技基础平台建设 | 中国农业科学院草原研究所（12.6万） | 王佺珍 | 70000 |
| 18 | 良种奶山羊多羔性状分子标记辅助多基因聚合育种技术研究 | 863专题 | 财政部拨 | 曹斌云 | 140000 |
| 19 | 猪脂肪沉积关键基因功能及其网络解析 | 863专题 | 财政部拨 | 杨公社 | 180000 |
| 20 | 秦川牛肉质性状相关功能基因鉴定 | 863专题 | 财政部拨 | 昝林森 | 180000 |
| 21 | 抗逆性桑品种选育 | “十一五”支撑计划(子课题) | 科技部（中国农科院蚕业研究所） | 苏超 | 20000 |
| 22 | 凡纳滨对虾重要生产性状遗传参数精确评估技术 | 863子课题 | 科技部（中科院海洋研究所） | 刘小林 | 47958 |
| 23 | 普那菊苣天然产物提纯鉴定的合作研究 | 国际合作项目 | 美国（财政部93万） | 王佺珍 | 630000 |
| 24 | 普那菊苣天然产物提纯鉴定的合作研究 | 国际合作项目 | 美国（财政部93万） | 呼天明 | 300000 |
| 25 | 黄牛双胚分子遗传基础研究 | 中华农科教基金 | 新疆农业大学 | 陈宏 | 40000 |
| 26 | 对虾选择育种和遗传参数研究 | 中科院开放课题 | 中国科学研究院海洋研究所 | 刘小林 | 15000 |
| 27 | 人工草地优质牧草生产技术研究与示范 | 公益性行业（农业）专项 | 甘肃农业大学 | 呼天明 | 112000 |
| 28 | SOCS-2在GH信号通路调控猪脂代谢中的分子机理及与SOCS-3的关系 | 国家基金 | 国家自然基金委（757.4万） | 孙超 | 228000 |
| 29 | Wnt/β-catenin信号通路在猪ADSCs定向分化为脂肪细胞中的作用及其机制 | 国家基金 | 国家自然基金委（757.4万） | 杨公社 | 192000 |
| 30 | CNT对秦川犊牛生长和肉质影响及调控机理研究 | 国家基金 | 国家自然基金委（757.4万） | 昝林森 | 80000 |
| 31 | 高效信号肽构建枯草芽孢杆菌木聚糖酶分泌表达系统筛选 | 国家基金 | 国家自然基金委（757.4万） | 龚月生 | 180000 |
| 32 | 奶山羊泌乳性状重要功能基因的鉴定与应用 | 863专项 | 财政部拨（科技部） | 雷初朝 | 300000 |
| 33 | 杀灭鱼类寄生虫原料药蛇床子素的仿生合成 | 常州市科技局专项 | 江苏省常州市武进动物有限公司 | 王高学 | 100000 |
| 34 | 抗逆性桑品种选育 | “十一五”支撑计划(子课题) | 中国农科院蚕业研究所 | 苏超 | 10000 |
| 35 | 奶山羊乳腺脂肪酸代谢基因网络分析 | 863专题 | 科技部（财政部拨） | 罗军 | 300000 |
| 36 | 虾夷扇贝的QTL定位 | 国家基金（合作） | 大连水产学院 | 刘小林 | 20000 |
| 37 | 陕南灾后绿色乡村社区建设技术集成与示范 | “十一五”支撑计划(课题) | 科技部（教育部） | 杨公社 | 2500000 |
| 38 | 草鱼模式识别受体基因的克隆与应用 | 回国留学人员启动基金 | 教育部（14万） | 苏建国 | 25000 |
| 39 | 西北农区生态型奶业生产技术和奶牛性控技术研究与开发 | “十一五”支撑计划(子课题) | 西安银桥生物科技有限责任公司（31.76） | 昝林森 | 286000 |
| 40 | 西北农区生态型奶业生产技术和奶牛性控技术研究与开发 | “十一五”支撑计划(子课题) | 西安银桥生物科技有限责任公司（31.76） | 昝林森 | 31600 |
| 41 | 鸭子遗传标记与新品系的选育 | “十一五”支撑计划(协作) | 浙江农科院畜牧所 | 刘小林 | 50000 |
| 42 | 优质、多用途桑树新品种筛选及配套技术试验与示范 | 公益性行业（农业）专项 | 西南大学 | 钱永华 | 200000 |
| 43 | 肉牛转型新概念BPI研究 | “十一五”支撑计划(子课题) | 中国农科院北京畜牧兽医研究所 | 张英汉 | 100000 |
| 44 | 草食家畜牧草新品种选育及产业化关键技术研究 | 省攻关 | 省科技厅（261万） | 呼天明 | 100000 |
| 45 | 奶产品标准化生产及产业化开发 | 省攻关 | 省科技厅（261万） | 孙超 | 30000 |
| 46 | 草食家畜牧草新品种选育及产业化关键技术研究 | 省攻关 | 省科技厅（261万） | 呼天明 | 100000 |
| 47 | 优质肉鸡良种规模化高效健康繁育关键技术研究与示范 | 省攻关 | 省科技厅（261万） | 高玉鹏 | 70000 |
| 48 | 普那菊苣天然产物提纯鉴定的合作研究 | 省国际合作项目 | 省科技厅（261万） | 王佺珍 | 40000 |
| 49 | 秦川牛瘤胃细菌元基因组文库构建与纤维素酶基因的克隆 | 省基金 | 省科技厅（261万） | 孙维斌 | 20000 |
| 50 | 西部高档肉牛产业化配套技术及产业化机制研究 | 公益性行业（农业）专项 | 中国农业大学 | 昝林森 | 1830000 |
| 51 | 秦川肉牛新品系选育 | “十一五”支撑计划(子课题) | 农科院北京畜牧兽医研究所（10万） | 昝林森 | 100000 |
| 52 | 国家肉牛改良中心建设 | 农业部项目 | 农业部 | 昝林森 | 3000000 |
| 53 | 鲈鱼反转录病毒（WDSV）辅助基因诱导肿瘤萎缩分子机理研究 | 国家基金 | 国家自然基金委（757.4万） | 张智英 | 180000 |
| 54 | 奶山羊良种繁育及产业化技术体系建设 | 公益性行业（农业）专项 | 罗军 | 2400000 |